Введение выборной системы полностью изменило ситуацию. Если в доколониальные
времена назначение на должность было результатом тщательного отбора кандидатов,
признания доверия к нему у населения и его компетентности, то выборная система
ослабила эти требования. Теперь все зависело от отношения кандидата к
колониальной власти, тем более, что ею утверждались результаты выборов. Не
всегда выборы были объективными и отражали мнение населения.
Должность казиев и биев стала выгодной и прибыльной. Они перешли в ведение
колониальных властей и стали служить им. Конечно, колониальные власти не
вмешивались в их деятельность, но сама выборность казиев и биев сделала их
верными служителями туркестанской администрации.
В 1886 г. было принято “Положение”,
которое внесло значительные изменения в судебную систему Туркестанского края.
Суды казиев сохранились, но уездные суды были упразднены, а их место заняли
участковые мировые судьи, которые должны были назначаться городскими и
земскими управлениями. Судебные отделения областных управлений были заменены
областными судами. Были введены должности судебных следователей, областных
прокуроров и их товарищей (заместителей). Областные судьи решали уголовные и
гражданские дела.
В 1898 г. судебная система вновь претерпела изменения. В соответствии с
“Правилами применения судебных уставов к областям Туркестанского края” были
ликвидированы областные суды и вместо них созданы окружные суды и
Ташкентская судебная палата, которая была наделена правами главной судебной
инстанцией всего Туркестанского края. Она подчинялась только верховной судебной
инстанции империи — Сенату.
Окружные суды были введены в пяти областях Туркестанского края. Они состояли
из председателя, его заместителя и членов суда. Меру наказания определяли судьи
и два члена суда. Апелляции на их решения рассматривал Сенат, который являлся
высшей судебной инстанцией в России.
Перед началом Первой мировой войны, после длительных дискуссий об их роли и
значении, было принято решение об упразднении шариатских судов в Туркестанском
крае. Весть об этом была встречена негативной реакцией, вызвав волну возмущения
не только со стороны коренных жителей, но и тех представителей русской
администрации, кто любил и знал этот край. Шариатские суды в Средней Азии
продолжали действовать на тех же основаниях вплоть до падения царской власти в
России.
Судебная реформа поставила всю судебную систему Туркестанского края в прямое
подчинение центральным властям. Судебное делопроизводство было надежной опорой
колониальной системы Российской империи в Туркестанском крае. Высшей инстанцией
по юридическим вопросам Туркестанского края был Санкт-Петербург.